WCS著名野生动物保护学家威廉•毕彼于20世纪30年代的时候在中国做过雉鸡类的研究，继威廉•毕彼后，首席科学家乔治•夏勒博士于20世纪80年代开始就长期在四川和羌塘开展大熊猫与高原有蹄类的保护工作。

　　1996年WCS在上海建立了中国项目办公室，2005年，中国项目的总部转移到北京。目前，WCS中国项目在西部青藏高原和帕米尔高原开展有蹄类保护，在东北地区开展跨国界东北虎保护，在长江中下游地区对扬子鳄和斑鳖进行保护，还在华南地区开展减少野生生物消费和贸易以及野生动物保护宣传教育项目，并于2008年启动了国内首个针对野生生物保护与执法的“中国边境野生生物卫士奖”。WCS注重与政府、社区合作，开展长期的野外科学研究，用收集到的野生生物与生态系统的第一手信息推动保护工作。到2008年底，WCS中国项目一共有4个办公室，分别是北京办公室、拉萨办公室、珲春办公室和广州办公室。目前WCS在中国拥有23位工作人员包括1名项目主任，5名项目主管，6名项目官员，7名项目助理，4名实习生。